Passer de cram à fisher exemple

Au début, j`ai essayé SAMtools-1. Lorsque j`essaie de l`exécuter sur mes fichiers, je reçois toujours des erreurs similaires. C`est comme si nous avions enveloppé la chaîne autour d`un tube cylindrique. Si nous visions d`en haut, nous devons tourner mentalement les liens de sorte que # “C-2” # et # “C-4” # pointent “vers le haut”. Nous ne tournons pas # “C-3” # et # “C-5” #, de sorte que les liens vers le # “OH” # groupes sur ces atomes restent les mêmes. Cela ressemble à un problème avec vos règles de pare-feu local/proxy. Pour la conversion en BAM, vous ne devez pas avoir besoin de la référence. La formule Wedge-Dash ressemble maintenant à celle de l`image ci-dessous (je l`ai recadrée à partir d`ici). Ensuite, j`ai installé CRAMtools-3. Depuis samtools et cramtools semblent avoir des problèmes avec les fichiers, il est probable que les fichiers eux-mêmes ont un certain problème. FastQ original? Ainsi, je suis à la recherche d`un petit fichier CRAM que je peux télécharger et utiliser pour tester le logiciel CRAMtools. Avez-vous d`autres suggestions pour les petits fichiers CRAM disponibles pour le téléchargement que je peux utiliser pour se familiariser avec ce type de fichier? Qu`est-ce que vous essayez d`obtenir des fichiers CRAM? Nous allons maintenant voir la molécule avec # “C-1” # en haut et avec tous les carbones chiraux les plus proches de nos yeux. Donc les # “OH” # groupes sur # “C-2” # et # “C-4” # deviennent des cales.

Vous devrez peut-être utiliser cette version spécifique. Il s`agit d`un tutoriel étape par étape pour convertir NGS Cram format en utilisant la trousse à outils CRAM et expliquant d`autres options dans la trousse à outils CRAM. Tu peux essayer? C`est la raison pour laquelle je me demandais s`il y avait des fichiers similaires. Lorsque nous faisons cela, les cales deviennent des tirets, et les tirets deviennent des coins, comme dans l`image ci-dessous. Serait utile d`inclure la commande samtools vous avez essayé. Sur le site Web de CRAMtools, ils se réfèrent à un fichier CRAM à télécharger (http://www. Est-ce ainsi que vos données ont été livrées? À l`appui de la CRAM, nous fournissons également le registre de référence CRAM. Mais la connexion au FTP ne fonctionne pas. Mtools lui-même, ou avec les fichiers CRAM-j`ai reçu.

Pouvez-vous demander au fournisseur si ils ont utilisé une ancienne version de samtools pour faire ces fichiers?.

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